Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmc2Q8K199 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmc2Q8K199 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms