Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt33aQ8K0Y2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt33aQ8K0Y2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms