Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ago3Q8CJF9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms