Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp27Q8CEG8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp27Q8CEG8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp27Q8CEG8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Usp27Q8CEG8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Usp27Q8CEG8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Usp27Q8CEG8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Usp27Q8CEG8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp27Q8CEG8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp27Q8CEG8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Usp27Q8CEG8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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