Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc27Q8CD92 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc27Q8CD92 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc27Q8CD92 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc27Q8CD92 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc27Q8CD92 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc27Q8CD92 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc27Q8CD92 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms