Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps53Q8CCB4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps53Q8CCB4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms