Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg4aQ8C9S8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms