Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifi27Q8C6G0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifi27Q8C6G0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifi27Q8C6G0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms