Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim47Q8C0E3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim47Q8C0E3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim47Q8C0E3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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