Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubash3bQ8BGG7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms