Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Katnb1Q8BG40 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 351 ms