Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Jmjd4Q8BFT6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Jmjd4Q8BFT6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms