Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf5Q7TSN7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf5Q7TSN7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Igsf5Q7TSN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms