Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700010I14RikQ7TPG0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700010I14RikQ7TPG0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700010I14RikQ7TPG0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms