Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyfip1Q7TMB8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cyfip1Q7TMB8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyfip1Q7TMB8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyfip1Q7TMB8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyfip1Q7TMB8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms