Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TwistnbQ78WZ7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TwistnbQ78WZ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms