Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sys1Q78S06 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sys1Q78S06 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms