Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eci3Q78JN3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Eci3Q78JN3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms