Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msrb2Q78J03 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msrb2Q78J03 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms