Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms