Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQL4

Wdr43, WD repeat-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr43Q6ZQL4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr43Q6ZQL4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Wdr43Q6ZQL4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdr43Q6ZQL4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms