Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx13Q6PHS6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx13Q6PHS6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms