Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PdgfrlQ6PE55 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfrlQ6PE55 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.1 ms