Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhb9Q6PB60 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhb9Q6PB60 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhb9Q6PB60 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhb9Q6PB60 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms