Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nop58Q6DFW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Nop58Q6DFW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nop58Q6DFW4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms