Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SypQ62277 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SypQ62277 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SypQ62277 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SypQ62277 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SypQ62277 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SypQ62277 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SypQ62277 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SypQ62277 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SypQ62277 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SypQ62277 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SypQ62277 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SypQ62277 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SypQ62277 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SypQ62277 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SypQ62277 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SypQ62277 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SypQ62277 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SypQ62277 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SypQ62277 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SypQ62277 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SypQ62277 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SypQ62277 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SypQ62277 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SypQ62277 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SypQ62277 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SypQ62277 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SypQ62277 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SypQ62277 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SypQ62277 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SypQ62277 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SypQ62277 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SypQ62277 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SypQ62277 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SypQ62277 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SypQ62277 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SypQ62277 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SypQ62277 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SypQ62277 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SypQ62277 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SypQ62277 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SypQ62277 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SypQ62277 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SypQ62277 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms