Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sin3bQ62141 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sin3bQ62141 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms