Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccne1Q61457 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccne1Q61457 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccne1Q61457 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms