Protein–RNA interactions for Protein: Q61048

Wbp4, WW domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wbp4Q61048 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wbp4Q61048 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wbp4Q61048 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wbp4Q61048 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wbp4Q61048 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wbp4Q61048 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms