Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Laptm4aQ60961 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Laptm4aQ60961 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms