Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk2a1Q60737 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms