Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SkiQ60698 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SkiQ60698 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SkiQ60698 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SkiQ60698 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SkiQ60698 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SkiQ60698 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SkiQ60698 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SkiQ60698 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SkiQ60698 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SkiQ60698 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SkiQ60698 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SkiQ60698 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkiQ60698 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkiQ60698 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SkiQ60698 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SkiQ60698 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkiQ60698 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkiQ60698 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkiQ60698 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SkiQ60698 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SkiQ60698 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SkiQ60698 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SkiQ60698 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkiQ60698 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkiQ60698 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkiQ60698 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkiQ60698 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkiQ60698 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkiQ60698 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SkiQ60698 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkiQ60698 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SkiQ60698 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms