Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a6Q5U4D8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc5a6Q5U4D8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms