Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp22Q5DU02 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp22Q5DU02 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms