Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNDC1Q4ZHG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FNDC1Q4ZHG4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms