Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc3lQ4KL14 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc3lQ4KL14 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms