Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnaaf3Q3UYV8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms