Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trat1Q3UU67 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trat1Q3UU67 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms