Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Obox3Q3UT54 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox3Q3UT54 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms