Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cln5Q3UMW8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cln5Q3UMW8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms