Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc33Q3ULW6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms