Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3UJP5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q3UJP5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3UJP5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3UJP5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UJP5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UJP5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UJP5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UJP5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms