Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmem109Q3UBX0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem109Q3UBX0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms