Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hddc2Q3SXD3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hddc2Q3SXD3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms