Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccbe1Q3MI99 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccbe1Q3MI99 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms