Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp8Q2V6D6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp8Q2V6D6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp8Q2V6D6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms