Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col19a1Q0VF58 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms