Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn2Q08093 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn2Q08093 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms