Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf3Q07104 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms