Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rcn1Q05186 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rcn1Q05186 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms